Uma vez dentro do painel Plesk, localize e clique no ícone Files

1) selecione todos os arquivos e pastas
2) Clique no botão Archive
3) Clique em Add to Archive
4) Dê um nome para o seu zip e clique em OK
Clique com botão direito do mouse na linha do arquivo zip gerado
Depois faça o download.
Obs: Não esqueça de apagar o zip após o download. Se você esquecer o zip em um diretório publico, alguém poderá baixar o código fonte do seu projeto.

